1908年（清光绪34年）拥有中药秘籍的重庆名士许健安，仰慕“药祖”圣德，前门开店，后门办厂，创办重庆最大的药房以广施仁德医术，取名“桐君阁熟药房”。自创办后不久，中国进入战乱年代，桐君阁也进入风雨飘零时期，每况愈下，举步维艰。桐君阁的历代传承人在风雨交加之时，竭力维持，多次改革，但始终秉承祖训，矢志不渝，迄今已走过了近110年的历程。翻过历史的画卷，步入岁月的长河，桐君阁依然屹立于传统中医药文化世界里，依旧闪烁着她独特的璀璨光芒。

一、1908-1950（解放前）

1.1908年，重庆名士许健安创办“桐君阁熟药房”。

2.许健安邀请名医陈玉书编著《桐君阁丸药提要》，至1911年已再版至2万册。

3.1949年，重庆市医药工业总产值约为24万元，其中产值最高的桐君阁药厂约为11万元，占46%。

二、1951-1977（改革开放前）

1.1951年，桐君阁、国新、亚西药房、光华国药公司、胜利国药号以私营公司合营组建重庆桐君阁药厂股份有限公司。

2.1958年，经南岸区工业局批准，将地方国营“庆余堂”药厂并入公私合营桐君阁药厂，合并后，名称为“公私合营桐君阁药厂”。

3.1963年、1977年，桐君阁药厂先后两次参与中国药典的起草工作。

4.1965年，公私合营重庆桐君阁药厂更名为“中国医药工业公司公私合营重庆桐君阁药厂”，正式转为国营企业。

5.1965年，成功研制“四君子合剂”，首创我国中药合剂新剂型，创造近代中药界阶段性成果。

6.1966年，重庆桐君阁药厂更名为重庆制药八厂。

7.1970年，国内第一个滴丸品种“芸香油滴丸”在桐君阁药厂投产。

三、1978-1998（改革开放后20年）

1.1978年，滴丸剂型荣获全国科技大会奖。

2.1978年，成功研发青蒿素抗疟药，全国科学大会授予桐君阁药厂“在我国科学技术研究中作出重大贡献者”荣誉奖状。

3.1979年，经重庆市经委批复同意，恢复重庆桐君阁药厂传统厂名。

4.1979年，国家工商行政管理局核准注册桐君阁药厂“桐君阁”商标。

5.1980年，桐君阁药厂防风通圣丸获国家医药总局优质产品奖。

6.1981年，桐君阁药厂银屑光敏胶囊获国家医药总局科技成果二等奖。

7.1981年，利用宫廷秘方开发研制出“生力雄丸”（原名雄狮丸）、“嫦娥加丽丸”，首创“微丸胶囊”剂型。

8.1982年，桐君阁药厂产品一粒止痛丹、天麻丸分别获得国家银质奖、省优质产品奖。

9.1996年，国家商务部授予桐君阁药厂“中华老字号”荣誉称号。

四、1998-2016（加盟太极后）

1.1998年，太极集团与重庆中药股份（有限）公司资产重组，重庆桐君阁药厂加盟太极集团。

2.2000年，桐君阁药厂被重庆市人民政府授予工业五十强企业。

3.2001年，“桐君阁”牌被重庆市评为著名商标。

4.2006年，重庆桐君阁药厂改制为太极集团重庆桐君阁药厂有限公司。

5.2009年，桐君阁药厂迁入南岸茶园新区，产能进一步扩大，利税节节攀升。

6.2011年，桐君阁药厂“传统丸剂制作技艺”被列入国家非物质文化遗产名录。

7.2014年，《桐君阁药厂生产经营的有效性管理》荣获“重庆市企业现代化创新成果管理一等奖”。

8.2016年初，桐君阁药厂李渡分厂竣工，新增年产能10亿元。

9.2016年，李渡厂区接待国家副主席李源潮、重庆市市长黄奇帆、政法委书记刘学普、国家药监局副局长孙咸泽等领导人。